Базовыми кафедрами института являются:
● кафедра «Горного дела, наук о Земле и природообустройства» Филиала «Мурманский арктический государственный университет» в г. Апатиты; http://www.arcticsu.ru/

Зав. кафедрой - д.т.н. С.В.Терещенко

●  кафедра «Горное дело» Апатитского филиала Мурманского государственного технического университета; http://af.mstu.edu.ru/

Зав. кафедрой - академик Н.Н.Мельников

Филиал федерального государственного бюджетного образовательного учреждения высшего образования «Мурманский арктический государственный университет» в г. Апатиты имеет право подготовки горных инженеров по следующим специальностям: «Открытые горные работы», «Подземная разработка рудных месторождений», «Обогащение полезных ископаемых», «Электрификация и автоматизация горного производства».
 
Мурманский государственный технический университет имеет право подготовки горных инженеров по двум специальностям «Подземная разработка месторождений полезных ископаемых» и «Открытые горные работы». Обучение проводится в течение первых двух лет (общетехнические дисциплины) в г. Мурманске; в течение последующих 2.5 лет - в г. Апатиты на базе Горного института КНЦ РАН.
 
Сотрудники института ведут преподавательскую работу в Филиале «Мурманский арктический государственный университет» в г. Апатиты и Апатитском филиале Мурманского государственного технического университета.